蜜蜂的選種要優選和純選相結合，年年選種，越選越好，使蜂種的優良性狀穩定地遺傳和發展下去。優選和純選包括三個互相聯系的方面，即蜂群的生產力、生物學特性和形態特征。蜂群的生產力主要看在同樣管理條件下的年產蜜量、產漿量和產蠟量，這是選種的重要指標。選蜜、漿、蠟產量高的群做種群和哺育群，促使生產力更高，是選種的重要目的。

生物學特征方面主要看蜂王的產卵力、哺育蜂兒的能力、工蜂的采集能力、分蜂習性、抗病力、抗逆性(包括越冬性能、越夏性能、抗敵害能力等)和性情的溫馴程度等。生物學特征與生產力關系密切，是選種的重要內容之一。

形態特征是指不同蜂種所具有的體型、體色、毛色、肘脈指數(由蜜蜂前翅上兩條脈紋相接點的位置變化反映出來的數據)和絨毛寬度等特征。通過形態特征可以區別蜂種的純度，反映整個種性遺傳的穩定性。提純復壯是必要的，否則，高產蜂群的優良特性就保不住。以優為主，優選和純選相結合的選種方法，在各個品種的蜜蜂的選種中都是適用的。不同品種的蜜蜂的優選和純選有不同的具體內容，但選種的目標都是為發揚其優點，克服其缺點；同一個蜜蜂品種，優選和純選的內容也不是固定不變的，而是不斷發展的，蜜蜂的良種選育，就是要打破品種原有的相對穩定的優和純，創造更高一級的優和純，這就是蜜蜂新品系和新品種的培育。

在蜜蜂的選種工作中常采用集團選擇的辦法，首先是根據生產力、生物學特性和形態特征，給本場每個蜂群作一個綜合評定；然后分成三類，產量高的純種為第一類作為種群，中等的為第二類，用于生產和分蜂，差的為第三類，要盡早淘汰蜂王，蜂群只用于生產。

種群的數量要多一些，母群選3-5群，父群選10群左右，采用集團繁育成混合繁育的方法讓其傳宗接代，并對其后代進行擇優淘劣，嚴格控制繁育。其次是種群的選配，種群選配有異質選配和同質選配兩種。選擇的父群和母群在性狀上各有特點稱為異質選配，在選種開始時，多數采用這種方法，這種方法能綜合和改良蜂種的種性；另一種是同質選配；即選擇的父群和母群性狀上比較一致，可用來鞏固其優良性狀。還有在蜂種混雜、退化的蜂場，最好向種蜂場引進同一品種的蜂王或種群，與原來蜂種進行交配，以便進行血液更新和復壯。具體做法是：

第一年用引進的種蜂作母群，培育的新王與本場原來種群培育的雄蜂交配繁殖，第二年用這些新蜂王作母群，從前一年引進的蜂王群中挑選父群培育的雄蜂進行反交，或進行連續兩代換種純選法，即從種蜂場引進幾只種王，作為母蜂養王和本場種用雄蜂交配，并把原場的老王一律淘汰換成新蜂王，第二年從另一種蜂場再引進幾只優良種王重復第一年的做法。經兩代換王和以后的選種，就能培育出優良的純種。

蜜蜂的選種工作中還有一種方法叫純系繁育，這種方法一般在育種蜂場進行，在生產單位很少使用。辦法是用連續兩代換種的方法，如果后代性狀比較整齊一致，這個群就可以單立一個純選系，連續幾代進行近親繁殖的選優、選純。純系繁育不在于純系本身的生產效果，而在于它的育種價值。用幾個來源不同、無血緣關系的優良純系進行純系間配種，可以培育出更有經濟價值的優良純種品系。